可按Ctrl+D收藏 蚂蚁资源网

蚂蚁资源网

系统树(系统树构建方法)

  • 全部评论(3)
  • 阿里
  • 首先你需要一个能够对序列进行编辑的软件(比如Mac系统的MacGDE、WIndows的BioEdit、Mega、Genuis、ClusterX等)对整个数据库排序(Alignment),就是把相似的位点放到一起去。同时你要决定构建树用的方法,一般来说用Maximum Likelihood(Paup)、Bayesian(Mr Bayes),不过在此之前先用Neibour-Joining(快速,不准确)看一看大概情况也是必要的然后就是把数据库里有Gap的部分切掉,然后放到构建树的程序(Paup、MrBayes等)去做树具体方法见那些软件的说明书…1981
  • 2021-11-27 04:33:08
  • Lu珊Han
  • 在距离方法中,链式聚类方法相对简单,并且不加权分组平均方法更实用。当使用的距离数据来自多基因的分析结果时,非加权分组平均方法可以获得可靠的系统生成树。对于离散特征分析方法,如果序列很小,则最大的简单方法是更好的系统生成树构造。然而,不同周之间的进化速率大,并且在进化率恒定的情况下,树的分支非常短,最大简单方法没有真正的系统树的一致判断。对于内置系统,统计分析的错误可能会影响构建的树木的可靠性。无论是基于距离的系统生成树重建方法,还是基于特征系统生成树重建方法,无法保证获得真实树描述对齐历史。大量的仿真实验可以比较这些施工方法的统计可靠性。仿真结果总结如下:通常,对于数据集,如果方法可以推断正确的系统关系,请使用其他流行的方法可以获得更好的结果。但是,如果模拟数据集中的序列很大,如果不同分支变化的变化率不同,则无需方法是非常可靠的。一般规则是分析具有不同距离矩阵方法和简单方法的数据集,如果可能发生类似的系统,则可以认为这样的树是非常可靠的。在实际应用中,系统发生的可靠性,涉及两个问题,即整个树及其组件(分支)多少?这是让右树的可能性而不是随机性,是正确的树的可能性吗?有很多方法可以解决这两个问题,是有效的重新采样技术称为自我试验(自动启动)已成为解决第一问题的主要方法,并且解决了两棵树的简单参数比较是问题的第二种典型方法。
  • 2021-11-27 04:31:59
  • erpang666
  • 观察生物进化系统树。 (1)请填出图中序号所代表的生物类群。 ①,(1)①爬行类 ②节肢动物 ③环节动物 ④哺乳类 ⑤苔藓植物 ⑥裸子植物 ⑦被子植物 ⑧藻类植物 (2)鱼类、两栖类、爬行类、鸟类、哺乳类 (3)裸子植物、被子植物 (4)始祖鸟(5)哺乳(6)共同祖先       亲缘
  • 2021-11-27 04:31:59
  • 商品推荐